Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL29Q96CT2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms