Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKD1Q969G9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms