Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BHMTQ93088 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMTQ93088 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMTQ93088 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMTQ93088 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMTQ93088 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMTQ93088 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHMTQ93088 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms