Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRF1Q92994 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRF1Q92994 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms