Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO1Q92973 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms