Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRG4Q92954 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PRG4Q92954 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRG4Q92954 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms