Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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