Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN4Q92575 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms