Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RUFY2Q8WXA3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUFY2Q8WXA3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms