Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPIRE2Q8WWL2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIRE2Q8WWL2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms