Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms