Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCAF4Q8WV16 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF4Q8WV16 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms