Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDI1Q8WTU0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDI1Q8WTU0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms