Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTRT1Q8TDG2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT1Q8TDG2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms