Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT6

NPLOC4, Nuclear protein localization protein 4 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPLOC4Q8TAT6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPLOC4Q8TAT6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPLOC4Q8TAT6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPLOC4Q8TAT6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPLOC4Q8TAT6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPLOC4Q8TAT6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPLOC4Q8TAT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPLOC4Q8TAT6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPLOC4Q8TAT6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPLOC4Q8TAT6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms