Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCPH1Q8NEM0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCPH1Q8NEM0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms