Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL3Q8ND23 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms