Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms