Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH13Q8NBN7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH13Q8NBN7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms