Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLRC2Q8NBF2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLRC2Q8NBF2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLRC2Q8NBF2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLRC2Q8NBF2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLRC2Q8NBF2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLRC2Q8NBF2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLRC2Q8NBF2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLRC2Q8NBF2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms