Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC63Q8NA47 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms