Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBR7Q8N806 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms