Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6T0

TOP6BL, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP6BLQ8N6T0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP6BLQ8N6T0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP6BLQ8N6T0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms