Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC155Q8N6L0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC155Q8N6L0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms