Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME8Q8N427 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NME8Q8N427 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME8Q8N427 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME8Q8N427 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms