Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CA13Q8N1Q1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CA13Q8N1Q1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CA13Q8N1Q1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CA13Q8N1Q1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CA13Q8N1Q1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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