Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP3Q8IZU3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP3Q8IZU3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms