Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMYD4Q8IYR2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms