Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms