Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FUNDC1Q8IVP5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FUNDC1Q8IVP5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms