Protein–RNA interactions for Protein: Q86YT6

MIB1, E3 ubiquitin-protein ligase MIB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB1Q86YT6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIB1Q86YT6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIB1Q86YT6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms