Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABP7Q86V35 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP7Q86V35 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms