Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG4DQ86TL0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG4DQ86TL0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms