Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEGR1Q7Z3B1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEGR1Q7Z3B1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms