Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS2ST1Q7LGA3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS2ST1Q7LGA3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms