Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms