Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM43BQ6ZT52 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms