Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMFQ6X4W1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms