Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHISA2Q6UWI4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHISA2Q6UWI4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms