Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A10Q6U841 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A10Q6U841 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms