Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms