Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM4Q6P4Q7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM4Q6P4Q7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM4Q6P4Q7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM4Q6P4Q7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM4Q6P4Q7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNNM4Q6P4Q7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNNM4Q6P4Q7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNNM4Q6P4Q7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms