Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LETMD1Q6P1Q0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms