Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD5Q6GMV2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD5Q6GMV2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms