Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms