Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF123Q5XPI4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms