Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF3Q5VWG9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF3Q5VWG9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms