Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOCADQ5VW36 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms