Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEX3CQ5U5Q3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEX3CQ5U5Q3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms