Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRTP1Q5TC63 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRTP1Q5TC63 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms